命运石之门：比翼恋理的爱人

本作故事风格和正片相反，是以主人公和社员的恋爱生活为主线。系统保留了正片产生分歧的手机系统，片头片尾曲都做了更新。
《比翼恋理的爱人》与原作不同，游戏中减少了那令人窒息的急促与严肃感，多出了一箩筐研究所成员之间日常的暧昧关系。由于《命运石之门》中存在许多时间轴，《比翼恋理的爱人》就是定位在同一个世界不同次元中的故事。此后还推出了PSP版和PC版的假想科学冒险游戏《命运石之门》的Fan Disc。根据再次重叠的D邮件试验，冈部伦太郎跳进了发散度3％的δ世界线。8名研究室成员全员集合在的世界线内，展开日常的恋爱喜剧作品。根据手提电话的操作，故事发生变化的“手机触发”系统也会留在本作中。而且OP跟ED都会作全新的制作。OP的作词作曲均有志仓千代丸负责，AFILIA SAGA East演唱的。负责ED演唱的是伊藤香奈子和Phantasm（CV：榊原唯）。